پاسخنامه تست های تالیفی فصل چهارم ژنتیک پزشکی ایمری
سوال ۱- ج .
💥اندو نوکلئازهای محدودگر (Restriction Enzymes)
توسط بسیاری و شاید تمام گونه¬های باکتری ساخته میشوند و موجب مصونیت باکتریها در مقابل آلودگی به فاژها در پدیدهای به نام محدودیت تنظیم شونده توسط میزبان میشوند.
د RE ها DNA فاژ را قبل از اینکه فرصتی برای همانند سازی بیابد تخریب میکنند.
گروههای متیل بیرون زده از شیار بزرگ در DNA باکتریایی مانع از عمل RE ها برروی DNA باکتری میشود.
💥 نامگذاری RE ها
حرف اول ← نشان¬دهنده جنس باکتری
دو حرف بعدی ← نشان¬دهنده گونه باکتری
حرف چهارم ← نشان¬دهنده سویه
عدد ← نشان¬دهنده آنزیمهای مختلفی که از یک سویه جدا شده است. مثلاً EcoRI، اولین REی است که از سویه RY13 مربوط به باکتری Escherichia coli جدا شده است.
🎯 @IRANgeneticS 🎯
یک RE و آنزیم(های) تغییر هم¬جنسش، یک سیستم محدودگر- تغییر (R-M; restriction-modification) را تشکیل میدهند. در برخی از این سیستمها دو فعالیت آنزیم توسط زیرواحدها یا دومینهای مجزایی انجام میشود.
دسته بندی RE ها براساس تفاوت در سیستم R-M و سایر ویژگیها انجام میشود که به شرح زیر است:
نوع I: چند زیرواحدی با سیستم R-M مرکب که در نواحی دور از توالیهای شناسایی در مکانهای متنوع DNA را برش میدهند.
نوع II: تک زیرواحدی با توالیهای شناسایی خاص اغلب به طول bp 8-4 که DNA را در درون توالی شناسایی یا بسیار نزدیک به آن برش میدهد. این دسته در کلون¬سازی ژن بسیار اهمیت دارند.
نوع III: چند زیرواحدی با سیستم R-M مرکب که دو توالی شناسایی غیرپالیندرومی معکوس را شناسایی میکند و DNA را bp30-20 خارج از توالی شناسایی برش میدهند.
اندونوکلئازهای محدودگر نوع
بسیاری از این آنزیمها محلهای هدفِ شش نوکلئوتیدی را شناسایی میکنند.
برخی RE ها با توالی شناسایی متغیر وجود دارند که DNA را در محلهای مشابه برش میدهند مانند آنزیم HinfI با محل شناسایی GANTC (N هر نوکلئوتیدی میتواند باشد).
بسیاری از این آنزیمها توالیهای شناسایی پالیندروم را برش میدهند.
برخی ازآنزیمها با یک برش دورشتهای ساده در وسط توالی انتهای تراز (Blunt) یا صاف (Flush) ایجاد میکنند مانند Pvu II، AluI و HaeIII. اما در اغلب آنزیمها، برش نامتقارن ایجاد میشود که انتهای آویزان ‘۵ یا ‘۳ به نام انتهای چسبنده (stichy) نامیده میشود مانند EcoRI
فراوانی توالیهای شناسایی در یک مولکول DNA
تعداد توالیهای شناسایی یک RE در یک مولکول DNA با طول مشخص از فرمول ۴^n قابل محاسبه است (n = تعداد نوکلئوتیدهای یک توالی شناسایی). بنابر این هرچه طول توالی شناسایی آنزیم بزرگتر باشد میانگین قطعات بوجود آمده در اثر برش آنزیم، بزرگتر است.
سوال ۲- الف .
سوال ۳-ب.
د YAC ها چون مقدار زیادی DNA را در خود جای می دهند بنابراین نعداد کلون های همپوشان کمتری نیاز میباشد و این از مزایای YACها است.
سوال ۴-د.
سوال ۵-د.
💥طول قطعه تکثیر شونده توسط PCR نباید از kb 3 بیشتر باشد و بهترین حالت طول کمتر ازkb 1 است. تکثیر قطعات kb 20 با روشهای معمول و البته با کارایی کم و قطعات تا kb 40 با روشهای خاص PCR قابل انجام است. مواد لازم برای PCR شامل DNA الگو، پرایمر، dNTP، MgCl2، بافر و آنزیم Taq مقاوم به حرارت است. به کمک PCR میتوان ناحیه خاصی از مولکول DNA را ظرف چند ساعت تکثیر نمود به شرطی که توالی دو انتهای آن مشخص باشد.
سوال ۶-الف.
مراحل: DNA Microarrays
۱٫ اولیگونوکلئوتیدهای نشاندارشده با فلئورسنس (پروبها) به اسلاید شیشهای میکروسکوپ اتصال مییابند.
۲٫د DNA هدف در معرض اولیگونوکلئوتیدهای نشاندار قرارگرفته و ردیابی میگردند.
۳٫ الگوی رنگی به طورخودکار توسط رایانه مورد آنالیز قرار میگیرد.
کاربرد:
۱٫ مطالعات بیان به منظور مشاهده بیان تمایزی هزاران ژن درسطح mRNA
۲٫ آنالیزگوناگونی DNA برای شناسایی جهش وتعیین نوع چند شکلی تک نوکلئوتیدی (SNP)
۳٫ آزمون برای حذف¬ها و درج¬های ژنومی توسط آرایه دورگه سازی ژنومی (CGH)
۴٫ ترکیبی از دو مورد ۲ و۳ یعنی SNP-CGH برای شناسایی ناهنجاریهای ژنتیکی خنثی نسخه مانند دیزومی تک والدی
سوال ۷-ب.
💥در ARMS-PCR واکنشهای PCR به صورت جفت انجام شده و از سه پرایمر اختصاصی برای تکثیر آلل نرمال، آلل جهش یافته و کنترل استفاده میشود. در واقع یکی از پرایمرها در هر دو واکنش یکسان است و پرایمر دیگر به شکل دو نسخه با تفاوت جزئی یکی ویژه توالی نرمال و دیگری ویژه توالی جهش یافته است.
سوال ۸-ج.
جدول ۳-۴ کتاب امری
سوال ۹-الف-
سوال ۱۰-ب.
توالی یابی نسل جدید (NGS) و آرایه CGH ممکن است واریانت هایی را ارائه دهند که بیماری زا بودن یا پلی مورفیسم (غیر بیماری زا) بودن آنها مشخص نباشد و با مشکل تفسیر مواجهه شویم.
سوال ۱۱-د. جدول ۴-۴ امری.
سوال ۱۲- ج.
د MLPA جهش¬های حذفی بزرگ و مضاعف¬شدگی را شناسایی می¬کند. در این روش، هر پروب دارای دو الیگونوکلئوتید نشاندار¬شده فلوئورسنس است. دو الیگونوکلئوتید هم¬جوار، با مولکول هدف هیبرید می¬شوند وتوسط لیگاز به هم اتصال می¬یابند. هر الیگونوکلئوتید در انتهای خود، دارای یک توالی پرایمر عمومی است و یکی از الیگونوکلئوتیدهای هر پروب دارای یک توالی Stuffer با طول متغیراست. این توالی¬ها توسط الکتروفورز موئینه¬ای، فراورده¬هایPCR را تفکیک می¬کنند.
مطالب مرتبط :
تست های تالیفی فصل چهارم ژنتیک پزشکی ایمری
ژنتیک پزشکی : تدریس فصل چهارم ژنتیک پزشکی امری (ایمری) جلسه اول
کارشناسی ارشد ژنتیک انسانی در یک نگاه، تعریف، رشته های مجاز، دروس و ضرایب، منابع، زمان آزمون ۹۷-۹۶
منابع مطالعاتی کنکور کارشناسی ارشد ژنتیک انسانی
کلاس های آمادگی کنکور کارشناسی ارشد ژنتیک انسانی
در پایان به دانشجویانی که تمایل دارند از مباحثی که از ژنتیک پزشکی ایمری در کانال ژنتیک پزشکی متعلق به همین سایت تدریس می شود استفاده کنند پیشنهاد می گردد از طریق این لینک به کانال ژنتیک پزشکی بپیوندند.