- ژن آزمونی که به سمت راست ژن مورد مطالعه متصل میشود و پلی پپتیدی را رمزدهی می کند که موجود میزبان قادر به تولید آن نیست چه نام دارد؟
الف) Leader gene
ب) Trailer gene
ج) Reporter gene
د) Pseudogene
- از کدام یک از روشهای زیر برای شناسایی جهش های شناخته شده استفاده میشود؟
الف) ARMS PCR ، الحاق نوكلئوتيدي
ب) SSCP. ARMS PCR
ج ) SSCP ، الحاق نوكلئوتيدي
د ) ریز آرایه DNA ، HPLC واسرشته
- کدام یک از فنون زیر برای شناسایی ژن، بدون اطلاع از پروتئین آن به کار گرفته میشود؟
الف) Zoo blot
ب) Reverse genetics
ج) Colony hybridization
د) Southern blot
- معمولاً درجه حرارت و زمان کدام یک از مراحل PCR متغیر است؟
الف) درجه حرارت و اسرشتی (Denaturation) و زمان دورگه سازی (Annealing)
ب ) درجه حرارت دورگه سازی (Annealing) و زمان توسعه (Extension)
ج ) درجه حرارت و اسرشتی (Denaturation) و زمان توسعه (Extension)
د ) درجه حرارت توسعه (Extension) و زمان و اسرشتی (Denaturation)
- در تهیه کتابخانه DNA از Oligo dT در چه مرحله ای استفاده می شود؟
الف) سنتز DNA از روی mRNA
ب ) حذف RNA از هیبرید RNA-DNA
ج) دو رشته ای نمودن DNA تک رشته ای
د) افزودن انتهای چسبنده به cDNA دو رشته ای
- مهم ترین امتیاز پلاسمیدهای PUC بر Pbr ها چیست؟
الف) وجود جایگاههای کلون کردن متعدد
ب ) سهولت انتخاب نوترکیب ها (یک مرحله ای)
ج ) حذف بخش های غیر ضروری به منظور کوچک نمودن اندازه
د) وجود مارکرهای انتخاب گر متعدد
- در خصوص Linker و Adaptor به عنوان تسهیل کننده های فرایند Ligation کدام گزینه درست است؟
الف) در Linker یک انتها صاف و یک انتها چسبنده است اما در Adaptor هر دو انتها صاف است.
ب ) هر دو انتهای Linker چسبنده و هر دو انتهای Adaptor صاف است.
ج ) هر دو انتهای Linker صاف و هر دو انتهای Adaptor چسبنده است.
د) در Linker دو انتها صاف و در Adaptor یک انتها صاف و یک انتها چسبنده است.
- روش gold standard برای غربالگری جهش کدام یک از موارد زیر است؟
الف) MLPA
ب) DNA microarrays(DNA chips)
ج) DNA sequencing
د) Karyotyping
- ریز ماهواره ها (Microsatellite) ……
الف) را می توان با PCR و سیستمهای ردیابی فلورسنت آنالیز کرد
ب) به طور عمده شامل تکرارهای GC:CC در ژنوم انسان هستند
ج) در آزمون paternity کاربرد ندارند
د) تکرارهای بیش از دو نوکلئوتید ندارند
- مزیت استفاده از اپتامرها نسبت به پادتن ها چیست؟
الف) بواسطه ساختار اسید نوکلئیکی دارای پایداری بیشتر و امکان تحمل Denaturation بیشتر است.
ب) اتصال اپتامر به پادگن در شرایط ویژه صورت می گیرد.
ج) نشاندار کردن اپتامرها از نشاندار کردن پادتن ها سختر است.
د) اپتامرها دارای نیمه عمر کمتری نسبت به پادتن ها هستند.
- در ارتباط با فناوری DNA و کاربردهای آن کدام گزینه درست است؟
الف) بلات ساترن تاکنون در آزمون تشخیص مبتلایان به شکننده موفق نبوده است.
ب) آزمون ARMS چند گانه برای شناسایی جهشهای فیبروز کیستیک موفق نمی باشد.
ج) بلات نورترن برای نشان دادن الگوی تمایزی مربوط به بیان یک ژن در بافتهای متفاوت کاربرد ندارد.
د) برخی اوقات جهشهای حذفی را میتوان با تعیین اندازه فرآورده PCR مشخص کرد.
- کدام گزینه زیر در خصوص Argonaute درست است؟
الف) نقش اساسی در اتصال RISC به FRNA دارد.
ب) در صورت بروز جهش در ژن آن miRNA بالغ، غیر فعال می گردد.
ج) باعث جلوگیری از اتصال RISC به p-body می گردد.
د ) باعث اتصال RNAi به پروتئین dsRBD می گردد.
- کدام گزینه زیر در خصوص روشهای Whole Genome Amplification صحیح می باشد؟
الف) در MDA انجام واکنش در هر حجمی امکان پذیر است.
ب) در روش PEP اندازه فرآورده DNA بیش از ۱۰۰۰۰۰ می باشد.
ج) در روش DOP دامنه خطای تکثیری بین لوکوس ها کمتر از ۶ می باشد.
د) در روش iPEP میزان خطای DNA پلی مراز حدودا کمتر از یک هزارم است.
- چهار پروموتور شایع جهت بیان ژنها در یوکاریوت عبارتند از :
الف) GAL10 ، ژن الکل اکسیداز، ژن گلوکوآمیلاز، ژن سلوبیوهیدرولاز
ب( LacZ GAL10، ژن الکل اکسیداز، Ap2
ج) ژن الکل اکسیداز، TrpA، ژن گلوکوآمیلاز، ژن سلوبیوهیدرولاز
د) ژن الکل اکسیداز، پروموتور Taq ، ژن گلوکوآمیلاز ، ژن سلوبیوهیدرولاز
- کدامیک از پرایمرهای زیر Anchor Primer هستند؟
الف) NV TTTTTTTTTTTT
ب) TTTTTTTTTTTTT
ج) CCCTCGTGCATCATCCCCC
د) TNCTNCTNYTCN
- در کدام یک از روشهای PCR زیر چهار پرایمر استفاده می شود؟
الف) Nested PCR
ب) Sequencing PCR
ج) PCR-RFLP
د) Semi-nested PCR
- در پزشکی قانونی کدام یک از موارد زیر به عنوان بررسی ژنومی بیشترین کاربرد را دارد؟
الف) STRS
ب) ORF ژنها
ج) اگزونها
د) پسودوژنها
- در کدام روش زیر از Hybridization و Ligation استفاده می شود؟
الف) MLPA
ب) CGH array
ج) Pyrosequencing
د) MALDI-TOF
- در خصوص ،PCR کدام گزینه زیر درست است؟
الف) امکان بررسی DNAی متعلق به هر منبع سلولی واجد هسته وجود ندارد.
ب) از آنزیم Taq DNA Polymerase حداکثر تا دمای ۷۵ درجه می توان استفاده کرد.
ج) امکان بررسی همزمان چند نوع DNA وجود ندارد.
د) امکان شروع واکنش با میزان فوق العاده ناچیز از DNA وجود دارد.
- کدام یک از روشهای زیر تدریجا جایگرین Northern blot شده است؟
الف) microarray, Real time-RT PCR
ب) FISH,CGH
ج) MAPH, Sequencing
د) MLPA, PCR-RFLP
- کدام یک از الگوهای ژنتیکی زیر برای بررسی نوترکیبی بیشترین کاربرد را داشته است؟
الف) Yeast
ب) Pea
ج) Drosophila melanogaster
د) Mouse
- مهمترین مزیت VNTR ها نسبت به SNP ها چیست؟
الف) عدم نیاز به هضم آنزیمی
ب) فراوان تر بودن در ژنوم
ج) داشتن آللهای زیاد
د) داشتن اندازه بزرگتر
- ناتعادلی پیوستگی (Linkage Disequilibrium) مطرح کننده چیست؟
الف) میزان بالای اتوزیگوسیتی در بیماری مورد نظر
ب) وجود چند جایگاه یا لوکوس ژنی مرتبط با بیماری
ج) گویا نبودن نشانگر (Marker) مورد مطالعه در خصوص خانواده
د) بالنسبه جدید بودن جهش مسبب بیماری
- با گسترش کدام تکنیک استفاده از Northern blot به شدت کاهش یافت؟
الف) Western blot
ب) Real time RT-PCR
ج) InSitu PCR
د) Colony bridization
- محدودیت بهره گیری از SYBR Green در Real time PCR در مقایسه با Taman Real time PCR چیست؟
الف) چسبیدن رنگ به dsDNAغیراختصاصی
ب) حساسیت پایین و مثبت کاذب پایین
ج) جذب نور در محدوده Visible
د) چسبیدن رنگ به پرایمرهای به کار رفته
- در ارتباط با پلاسمید 19 pUC گزینه درست کدام است؟
الف) دارای ناحیهZ’ است که زیر واحد آنزیم آلفا – گالاکتوزیدان را کد می کند.
ب) از جمله ناقلان (Vectors) طبیعی پلاسمیدی است که مورد دستکاری قرار نگرفته است.
ج) از جمله ناقلان نسبتا بزرگ و فاقد انعطاف پذیری است.
د) دارای ناحیه Ori است که تعداد نسخه های پلاسمید را در باکتری تنظیم می کند.
- کاربرد MLPA چیست؟
الف) تعیین توالی DNA
ب) کلونینگ و اتصال DNA در پلاسمیدها
ج) تعیین تعداد سانترومر
د( ارزیابی تعداد نسخه های توالی مورد نظر و جهشهای حذفی
- تکثیر DNA در تعیین توالی به روش سنگر چگونه است؟
الف) به صورت تصاعد هندسی افزایش می یابد.
ب( در دو انتهای هر زنجیره dNTP وجود دارد.
ج) در انتهای 5’ زنجیره DNA یک ddNTP وجود دارد.
د) به دلیل توقف در هر سیکل، خطی میشود.
- در خصوص SNP کدام گزینه صحیح است؟ .
الف) در هر ۳۰۰۰ باز، یک باز در ژنوم انسان تنوع دارد.
ب) در نواحی غیر کد کننده ژنی وجود ندارد.
ج) میتوانند تا بیش از ۵۰ آلل داشته باشد.
د) جهت مطالعات association در بیماریهای شایع استفاده می شود.
- در MLPA پس از بخش استافر ، در پروب چه توالی وجود دارد؟
الف) پرایمر برای PCR
ب) سایت آنزیم محدود کننده
ج) پرایمر برای اتصال به ژنومیک DNA
د) اختصاصی برای اتصال به محل حذف شده
- در ساترن بلات کدامیک از موارد زیر نشان دار و به عنوان پروب استفاده میشود؟
الف) Total RNA
ب) پپتیدهای با اندازه کوتاه
ج) Digested whole genomic DNA
د) محصول PCR
- در صورتی که درجه حرارت Annealing پرایمر 72 درجه سانتی گراد باشد در مراحل (سیکل های) PCR دچار چه تغییری می شود؟
الف) دو مرحله ای می شود.
ب) چهار مرحله ای می شود.
ج) احتمال تولید محصولات غیر اختصاصی (non-specific) افزایش می باید.
د) تغییری در مراحل ایجاد نمی شود.
- کدام ویژگی مربوط به فاز M13 است؟
الف) پس از تکثیر موجب مرگ میزبان خود میشود.
ب) به دلیل اندازه کوچک ژنوم، تا بیش از هزار نسخه از آن در میزبان تکثیر میشود.
ج) فرم Replicative مربوط به ویروس دارای DNAی حلقوی و دو رشته ای است.
د) رشته منفی DNA وارد غلاف پروتینی فاز پروتیی فاژ می شود.
- نقش ddNTPs در واکنش تعیین توالی DNA چیست؟
الف) کاتالیز واکنش
ب) قرار دادن نوکلئوتید رادیواکتیو در زنجیره DNA
ج) تسهیل سنتز زنجیره DNA
د) پایان دادن به سنتز زنجیره DNA
- در مورد Real-time PCR به روش Taqman مناسب ترین گزینه کدام است؟
الف) وجود دو پرایمر کافی است.
ب) دو پرایمر و دو پروب لازم است.
ج) دو پرایمر و یک پروب لازم است.
د) دو پروب کافی است.
- با روش Next generation clonal sequencing می توان ….. را برای …. شناسایی کرد.
الف) جهش های شناخته شده – هر ژن
ب) جهش های شناخته شده و شناخته نشده – هر ژن
ج) جهش شناخته نشده – ژنهای خاص
د) جهش های جایگزینی بازی – ژن های با اندازه بیش از ده کیلو باز
- تفاوت ARMS-PCR و PCR-RFLP در چیست؟
الف) در استفاده از آنزیم Taq
ب) در استفاده از آنزیم محدود کننده
ج) در استفاده از آنزیم MMLV
د) ضرورت sequencing برای PCR-RFLP
- بکارگیری کدامیک از تکنیکهای زیر نیازمند حجم انبوهی از آنالیز داده ها میباشد؟
الف) Pyrosequencing
ب) High Resolution Melting
ج) Next generation sequencing
د) Immunohistochemistry
۲۵ در الکتروفورز ژل پلی اکریلامید (PAGE) و در مراحل بستن ژل کدام ترکیب زیر نقش کاتالیزور دارد؟
الف) Acrylamide
ب) Bis acrylamide
ج) Tetra methylen diamide (TEMED)
د) Ammonium persulfate (APS)
- کدام روش زیر برای تشخیص سریع آنیوپلوئیدی پیش از تولد مناسب تر است؟
الف) Pyrosequencing
ب) QF-PCR
ج) dot blot
د) gene tracking
- در ارتباط با فن آوری DNA و مهندسی ژنتیک گزینه درست کدام است؟
الف) فن HRM میتواند برای غربالگری جهشها با کیفیت بالا به کار رود.
ب) فن MLPA برای شناسایی واژگونیهای ژنی به کار می رود.
ج) فن آرایه ی CGH برای شناسایی دو تا شدگیها در مقیاس کل ژنوم استفاده نمی شود.
د) ARMS-PCR یکی از روشهای تشخیص جهشهای ناشناخته است.
- کدام روش زیر با تشکیل و تعیین هترود و پلکس در محصول PCR جهش را تشخیص می دهد؟
الف) SSCP
ب) RFLP
ج) DHPLC
د) OLA
- کدامیک از روشهای زیر میتواند جهت شناسایی Copy Number variation ناشناخته نیز به کار
رود؟
الف) MLPA
ب) QF-PCR
ج) Array CGH
د) RT-PCR
- اگر کامپیوترها قادر نباشند که به توالی کامل ژنوم یک ارگانیسم دسترسی داشته باشند کدامیک از تکنیک های زیر میتواند امکان تعیین توالی ژنی را که یک پروتئین خاص را کد میکند برای محقق فراهم آورد؟
الف) PCR amplification of related gene sequences
ب) Hybridization of a genomic library with a degenerate probe
ج) Production of synthetic peptides
د) CDNA library and microntray
- کدامیک از روشهای تشخیصی زیر برای عوامل بیماری های عفونی نتایج سریع تری ارایه می دهد؟
الف) CGH
ب) FISH
ج) Real time PCR
د) PCR-RFLP
- کدامیک از آنزیم های زیر تنها فقط یک محل برش در پلاسمید دارند؟
الف) آنزیم هایی که Multiple cloning site را برش میدهند.
ب) آنزیمهایی که مارکر پلاسمیدی را برش میدهند.
ج) آنزیم هایی که جایگاه برش چهار نوکلئوتیدی دارند.
د) آنزیم هایی که جایگاه برش شش نوکلئوتیدی دارند.
- جهت بررسی وضعیت کروموزوم ها از نظر مضاعف شدگی یا حذف در بیماران مناسب ترین روش کدام می باشد؟
الف) Southern blot .
ب) CGH array
ج) ARMS-PCR
د) RFLP-PCR
- در تشخیص پیش از تولد با استفاده از QF – PCR کدام یک از موارد زیر مورد استفاده قرار میگیرد؟
الف) Microsatellites
ب) Mini satellites
ج) VNTR
د) STR
- در رابطه با ناقل PUCB کدام گزینه صحیح میباشد؟
الف) وجود جهش تصادفی در ناحیه Ori که سبب افزایش فعالیت ناقل میشود.
ب) ژن Lao2 آن جهش یافته است.
ج) از ناقل لامبدا مشتق شده است.
د) در ساختن کتابخانه ژنومی کاربرد زیادی دارد.
- در کدام یک از روشهای زیر امکان بررسی همزمان چندین جهش به طور هم زمان در یک واکنش وجود دارد؟
الف) Southern blot
ب) MLPA
ج) FISH
د) Taqman real time PCR
- کدام گزینه در مورد ژن گزارشگر صحیح می باشد؟
الف) باید پلی پپتیدی را رمز کند که پیشتر در اندامگان میزبان بیان شده باشد.
ب) باید فاقد بیان در اندامگان میزبان باشد
ج) به ناحیه سمت راست ژن مورد مطالعه متصل می گردد
د) بهتر است بتوان فنوتیپ آن را به صورت کیفی آزمون کرد
- آرایه CGH قادر به تشخیص
الف) تغییرات نسخه DNA در سطح ۵ تا ۱۰ کیلو باز است.
ب) تغییرات نسخه DNA در سطح ۲۰ تا ۵۵ کیلو باز است.
ج) جابجایی های متعادل میباشد.
د) وارونگی ها میباشد.
- کدام گزینه زیر از کاربردهای مهم روش Multiple ligation dependent probes amplification) MLPA می باشد؟
الف) بررسی اختلالات تکوینی شدید
ب) بررسی حذف های زیر تلومری
ج) بررسی پیش از تولد تریپلوییدی
د) بررسی اختلالات شنوایی
- در کدام روش زیر از آنزیم DNase استفاده می شود؟
الف) PCR-RFLP
ب) ARMS-PCR
ج) Real-time-PCR
د) Northern blotting
- در حالت موزاییکی که کمتر از دو درصد سلولها دارای جهش هستند کدام روش زیر برای تشخیص جهش مناسب تر است؟
الف) DGGE
ب) SSCP
ج) GAP PCR
د) Droplet digital PCR
- استفاده از کدام تکنیک زیر موجب شده است که ایجاد مدل موشی دارای جهش خاص در مدت کوتاه امکان پذیر گردد؟
الف) Array-CGH
ب) FISH
ج) Cre-loxp
د) CRISPR
- شناسایی عناصر تنظیمی در DNA از اهداف کدام یک از پروژه های زیر می باشد؟
الف) Hap-Map
ب) Regulome
ج) ENCODE
د) GTEx
- چند درصد از ژنوم انسانی در تنظیم بیان ژن نقش دارد و این امر را کدام یک از پروژه های ژنوم انسانی مشخص ساخت
الف) ۲۰% – پروژه EMBL
ب) ۴۰% – پروژه GTEX
ج) 60% – پروژه UCSC
د) 80% – پروژه ENCODE
- در روش ساترن بلات پس از برش DNA توسط آنزیم محدود الاثر کدام مرحله انجام می گیرد؟
الف) الکتروفورز قطعات
ب) انتقال قطعات DNA به فینتر نیترو سلولز
ج) دو رگه سازی با پروب
د) اتورادیوگرافی
- کدام یک از پروتئینهای زیر در Genome editing کاربرد دارد؟
الف) M13
ب) MCS
ج) AZAP
د) ZFN
- پروژه Hap Map در خصوص کدام قسمت ژنوم طراحی شد؟
الف) شناسایی فراوانی (Short Tandem Repeat (STR ژنوم انسانی
ب) شناسایی فراوانی موتاسیونهای بیماری زایی ژنوم انسانی
ج) شناسایی فراوانی (Single Nucleotide Polymorphism (SNP ژنوم انسانی
د) شناسایی فراوانی ژنهای فعال انسانی
- برای تشخیص سطوح بسیار پایین جهش مانند جهش های موزاییک اکتسابی در نمونه DNAی جنینی فارغ از سلول برای جهشهای به ارث رسیده ی پدری کدام روش بسیار حساس است؟
الف) Southern Blot
ب) Droplet Digital PCR
ج) ARMS PCR
د) Real-time PCR
- علمی که در آن زیست شناسی مطالعات عملکردی و فناوری اطلاعات همراه با فنوتیپ ادغام می شوند تا تفسیر توالی های متغیر را آسان نمایند که بتوان موارد قابل پیش بینی به وجود آورد. چه نامیده میشود؟
الف) سیستم بیولوژی
ب) بیوانفورماتیک
ج) تعیین توالی نسل آینده NGS
د) ژنومیک مقایسه ای
- کدام روش زیر برای بررسی واریانتهای توارثی در حالت Cis مناسب است؟
الف) Sanger seq
ب) Haplotype seq
ج) Short read seq
د) Long read seq
- ناقل ژنتیکی انتخابی برای انجام Mismatch Mutagensis کدام مورد زیر است؟
الف) باکتریوفاژ لامبدا
ب) فارمید f1
ج) باکتریوفاژ M13
د) پلاسمید 3-PET
- از پایگاه داده جمعیتی مانند Genome Aggregation به چه منظوری استفاده میشود؟
الف) بررسی فراوانی یک واریانت پاتوژنیک فرضی در کنترلهای سالم
ب) بررسی حفاظت شدگی توالی ها در میان پارالوگها و ارتولوگها
ج) بررسی پاتوژنسیتی واریانت جدید
د) پیش بینی اثر واریانت بر روی محصول پروتئینی
- کدامیک از متدهای زیر اختصاصیت specificity و مقدار امپلیفیکاسیون بیشتری دارد؟
الف) Exponential strand displacement amplification
ب) Helicase-dependent amplification
ج) Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)
د) Double Minute
- کاربرد بالقوه Potential Applications کدامیک از روشهای پروتئومیک زیر در تحقیقات بالینی میکروبیوم است؟
الف) expression proteomics
ب) structural proteomics
ج) functional proteomics
د) metaproteomics
- خصوصیت برنامه کامپیوتری MERCATOR چیست؟
الف) Uses only coding exons as initial anchoring points
ب) Analyzes rearrangements in pairs of genomes
ج) Multiple global alignment of genomic sequences
د) A consistency-based multiple-alignment program
- کدامیک از روشهای زیر برای تشخیص دیستروفی عضلانی دوشن مناسب تر است؟
الف) MLPA
ب) FISH
ج) QF-PCR
د) RT-PCR
- تعیین موقعیت ژن مربوط به اختلال اتوزومی مغلوب با بررسی خانواده هایی درگیر که ازدواج خویشاوندی در آنها انجام شده است. چه نامیده می شود؟
الف) Autozygosity mapping
ب) Contig mapping
ج) Genome wide scan
د) Multipoint linkage analysis